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CSCO现场报道:和瑞基因大Panel助力中国肿瘤诊疗领域新发展

  • 作者:股浪如潮
  • 2020-09-23 14:33:33
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目前已有数款大Panel产品FDA获批。在肿瘤基因检测领域,覆盖更多基因和位的NGS大Panel逐渐成为精准医学发展道路的未来和重要趋势。

国内部分头部基因检测公司也正在积极进行大Panel产品的研发和申报工作。值得关注的是,和瑞基因,专注于肿瘤全病程的基因检测行业代表企业,今年推出了一款具有代表性的大Panel“和全安—实体瘤全靶基因检测(654基因)产品”,前瞻性的产品设计,引发行业极大关注。

正值2020CSCO之际,小编也关注到和瑞基因在9月23日举办“瑞变,遇见新未来——和瑞基因大Panel赋能肿瘤精准诊疗之路卫星会”。下面,基因谷将带来此次会议的相关报道。

大Panel检测——精准医学发展道路的未来

在肿瘤精准治疗领域,基因分型指导用药对个体化治疗至关重要。由于基因突变的复杂性以及现代靶向药物的多样性,NGS技术已成为临床病理诊断的重要辅助手段。

随着肿瘤基因组研究的不断深入,发现的肿瘤靶基因也越来越多,突变的类型也越来越多。要实现精准的分型就需要进行多基因、多种变异类型的检测。多项泛瘤种适应症和国际指南共识也反复强调,以分子分型为依据的药物,要采用大Panel的基因检测方式。以肺癌为例,2020NCCN非小细胞肺癌指南明确提出,建议进行更广泛的分子检测,即NGS 大Panel检测,以期给患者带去更大获益(如图1所示)。

图1 2020NCCN非小细胞肺癌指南

免疫治疗的兴起,导致相关生物标志物的检测需求增加,进一步的推动大Panel的临床应用。以肿瘤突变负荷(TMB)为例,TMB对检测技术要求很高,只能依赖于高通量测序,要求检测的基因数量要至少在300个以上,并且检测的Panel要达到1M,才能保证TMB检测的准确性。

另一方面,从肿瘤样本有限、肿瘤患者时间宝贵、复发耐药所检测的肿瘤突变较多等实用角度,大Panel可以同时检测多个基因、多个位,筛选出更多的药物作用靶,更容易发现罕见的基因变异形式,为临床提供更全面、精准的结果,更好的指导用药和治疗,大Panel逐渐被临床所认可,在肿瘤精准诊疗中的价值日益凸显。

大会主席上海交通大学附属胸科医院陆舜教授指出大Panel在免疫和靶向方面提供了全面的息和完整的解决方案,为临床诊疗的选择提供了非常有意义的参考。南昌大学第二附属医院刘安教授等专家也表示无论是从检测的便利性、成本、准确性,还是在监测病人的耐药方面,二代NGS测序技术有非常多的优势,以分子分型为依据的药物,主张进行大panel检测,以给予病人最好的治疗。

作为国内大Panel的代表,和瑞基因和全安——实体瘤全靶基因检测(654基因)产品覆盖654个肿瘤发生发展相关基因,检测单核苷酸变异(SNV)、插入/缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)和拷贝数变异(CNV)多种基因变异类型,识别与肿瘤相关的体细胞突变、102基因的胚系突变,为肿瘤靶向治疗、肿瘤遗传评估及化疗药物选择提供参考。同时检测免疫治疗相关指标PD-L1表达水平、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星(MSI)状态、HLA分型、肿瘤新抗负荷(TNB)等,为肿瘤免疫治疗提供更全面的参考息。

DNA+RNA双重检测——洞见更全面的基因息

基因融合是肿瘤发生发展的重要驱动因素,目前也有越来越多实体瘤相关融合基因被揭示。基因融合发生率相对于其他变异类型来说不算高,但是相关靶药的疗效极为显著,比如广谱抗癌药拉罗替尼和恩曲替尼可改善NTRK融合阳性实体瘤患者的预后,而阿来替尼可使EML4-ALK融合的非小细胞肺癌患者的无进展生存期延长至34.8个月。

同时,多个融合基因已被纳入NCCN指南。在2020版《结直肠癌NCCN指南》中,专家建议对于已用IHC检测NTRK融合阳性的患者,由于检测方法的局限性可能存在假阳性率高的现象,故而推荐再用RNA-NGS确诊。

和瑞基因卫星会上,陆舜教授认为DNA+RNA双重检测可以提升融合检测的检出率,解决仅有DNA水平检测融合的灵敏度问题。基因融合精准检测的重要性已逐渐被认可,并得到广泛关注。

陆舜教授

与此同时,基因融合的结构非常复杂,一个驱动基因可能会与多种融合伴侣发生融合,而融合伴侣可能是基因组中的其它基因、基因间区域以及靶基因本身;另外,融合的断通常分布在一个区域内,而非固定的热。这些问题给融合检测带来了极大的挑战和技术壁垒,因此,目前国内外可以实现DNA+RNA双重融合检测的大Panel产品寥寥无几。

南昌大学第二附属医院刘安教授谈到Panel越大,目标检测区域越大,基因的变异检测性也就越准确,肿瘤突变负荷检测也是准确的。此外,和全安——实体瘤全靶基因检测(654基因)产品全面性纳入了42个目前已知的跟用药相关的融合基因,以及致瘤性的融合基因;可以进行DNA、RNA双重融合检测,显著提高融合检测的准确性

刘安教授

另,在今年8月和全安产品上市会中获悉,和全安产品采用的是高灵敏度的基因融合检测算法SVscan,它可以同时兼容DNA和RNA检测的融合分析,并且针对第三方的开源的融合分析软件的融合变异检出率能提升26.7%,从而让更多患者得到精准的诊断从而获得精准的治疗。

图. 和全安基因检测Panel(654基因)覆盖的融合基因检测相关基因

和瑞基因大Panel——助力免疫治疗临床科研与靶向治疗临床实践全面开花

一款好的肿瘤基因检测产品从设计到临床应用,中间必须经历一个对技术灵敏性、产品稳定性等各方面都有要求的分析验证过程。凭借多年积累的技术优势和卓越的产品性能,和瑞基因和全安实体瘤全靶基因检测(654基因)在科研和真实世界的临床都经受了高标准验证。对此,陆军军医大学新桥医院朱波教授、南昌大学第二附属医院刘安教授进行了详细的介绍。

和瑞基因cSMART技术助力肺癌免疫临床研究,打开免疫精准治疗新局面

朱波教授表示cSMART全球专利技术高效、灵敏、定量的特满足了外周血监测新生抗的技术要求,为免疫治疗临床研究奠定技术基础。基于cSMART技术的和瑞基因大Panel,覆盖638个基因的全外显子区域,3M+检测区间,使得与WES检测TMB结果一致性高达0.99,为精准指导免疫治疗做足了技术准备

此前,朱波教授与和瑞基因合作,基于cSMART技术,利用个体化探针Panel实现了免疫检抑制剂治疗过程中肿瘤新生抗的动态追踪,有效克服新生抗动态追踪难题。相关研究登顶《Advanced Science》(IF=15.804)国际期刊,为免疫精准治疗打开新局面。

该研究结果发现,基于个体化探针Panel的ctDNA测序可有效追踪出外周血样本中大部分(80%-100%)预测的优势新抗,检测到的突变基因数量远比固有商业基因探针Panel可检测的数量要多(18-30个)。更重要的是,该策略的应用有助于理解免疫检抑制剂(ICB)驱动的肿瘤进化,为个性化的肿瘤治疗提供了有益的参考,最终可使受检患者临床获益。

朱波教授

和瑞基因大Panel助力临床罕见突变新发现,使患者获益最大化

刘安教授介绍到和瑞基因大Panel,覆盖3M+检测区域,特殊优化的cSMART捕获流程,DNA+RNA融合双重检测,特有的融合专利算法,15000X的测序深度,100%的灵敏度,为罕见突变的检出奠定了技术基础。在与和瑞基因通力合作过程中,通过和瑞基因检测技术助力2例多发转移肺癌患者发现罕见突变,临床用药后脑部转移灶消失,肺部病灶缩小,为患者带来显著生存获益,临床实践分享登顶《Journal of Thoracic Oncology》(IF=12.46)国际期刊。

结语

没有精准的检测,就没有精准的治疗。基于高通量测序技术的大Panel产品能够提供全面详尽的肿瘤变异息,除靶向用药指导、免疫治疗指导、遗传风险评估外,在罕见突变检测、复发耐药、预后监控等方面也有着重要的临床价值。相在可见的未来,将会有更多的大Panel产品的出现和获批,为肿瘤的诊疗工作带来更多便利,促进中国精准医学更进一步的跨越。

关于和瑞基因

和瑞基因作为贝瑞基因成员企业创立于2017年,是一家专注肿瘤全病程的基因检测公司,在“一切肿瘤实现早诊早治,所有患者获得精准治疗”的使命引领下,建立了针对肿瘤高危人群和患者的完整基因检测产品服务体系包括肿瘤遗传易感性分析、早期筛、靶向与免疫用药检测、疗效监测、预后判断等系列产品。在肿瘤早期筛诊断领域,启动了包括肝癌、肺癌、妇科肿瘤等一系列早筛早诊临床研究项目;完成了两地(福州、北京)三中心(实验、超算、研发)的布局;致力于为临床肿瘤诊疗和个人健康管理提供更精准的肿瘤基因检测服务,合作和服务网络覆盖全国400多家三甲医院,已为数十万肿瘤患者提供了有价值的肿瘤基因检测服务。


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